เควสนี้จะเริ่มเควสแบบอัติโนมัติ หลังจากที่จบเควส Institutionalized (คุยกับหัวหน้าแผนกต่างๆที่อยู่ชั้นล่างครบหมดทุกคนแล้ว) ให้เราเดินกลับไปคุยกับ Father ที่ห้องด้านบน ลูกเราจะเล่าเกี่ยวกับ Synth ซึ่งจะมี Synth อยู่ตัวหนึ่งถูกลบความจำออก แล้วสงสัยว่า Synth ตัวนี้ได้กลายเป็นผู้นำของพวกไรเดอร์ จะให้เราไปช่วยจัดการให้หน่อย (ซึ่งก่อนหน้านี้ได้ส่ง Courser ไปจับตัวมาแล้ว แต่อยากให้เราไปช่วยอีกแรง)
เมื่อคุยจบ ให้เราเดินทางไปทางเหนือของเมือง Libertalia หรือทางด้านขวาของแผนที่ (ดูในรูปด้านบน) เมื่อมาถึงสถานที่เป้าหมายแล้ว เราจะเจอ Courser ยืนรอเราอยู่ด้านหน้า คุยกับเค้าแล้วเลือกว่าเราพร้อมแล้ว ก็จะเป็นการเริ่มบุกเข้าไปในรังของพวกไรเดอร์เลย
ในบางครั้ง เวลาที่เราบุกเข้าไป เราจะเห็นมีเรือบินขนาดใหญ่มาทิ้งระเบิด และปล่อยคนใส่ชุดเกราะลงมา นั่นคือพวกของ Brotherhood of Steel เราจะสังเกตว่า พวกนี้จะลงมายิง Courser ที่เป็นคู่หูเรา แต่ถ้าก่อนหน้านี้เราไม่เคยฆ่าหรือเป็นศัตรูกับพวก Brotherhood of Steel เค้าก็จะไม่ยิงเรา
ให้เราพยายามหาทางเข้าไปด้านในสุด ที่เป็นซากเรือใหญ่ๆ โดยระหว่างทาง ให้ระวังพวกไรเดอร์ที่ดักซุ่มอยู่ และระเบิดที่จะขว้างมาหาเรา เมื่อมาถึงเรือลำใหญ่ด้านในสุดแล้ว ให้เราขึ้นมาด้านบน ก่อนเข้าประตูเพื่อไปดาดฟ้า จะมีห้องที่มีของและอาวุธสุดยอดยู่คือ “Le Fusil Terribles” อย่าลืมเก็บไปด้วย และจะมีบทสนทนากับ Courser ซึ่งจะบอกเราว่า บอสของไรเดอร์ที่เป็น Synth จะมีรหัสปิดตัวเองอยู่ เราสามารถบอกรหัสนี้กับบอสได้แล้วระบบจะปิดตัวเอง แต่ให้ระวังเพราะบอสอาจจะไม่ได้อยู่ตัวเดียว เมื่อเราพร้อมแล้วก็ปีนบันไดขึ้นไปชั้นดาดฟ้าเรือได้เลย
เมื่อขึ้นมาแล้วให้เราเดินไปคุยกับบอสที่เป็น Synth แล้วเลือก “Use Recall Code” บอสก็จะยืนนิ่งอยู่เฉยๆ แล้วเราก็จัดการ ไรเดอร์ที่เหลือให้หมด Courser ก็จะพาตัว Synth วาร์ปกลับไปที่ฐาน เมื่อมาถึงฐาน Institute แล้ว ให้เราขึ้นไปคุยกับ Father เค้าจะขอบคุณเรา และบอกว่าได้เตรียมห้องไว้ให้เราเรียบร้อยแล้ว เมื่อคุยจบ ให้เราเดินไปที่ห้องของตัวเอง เมื่อเดินมาถึงห้อง เราจะเจอ Courser X6-88 รอเราอยู่หน้าห้อง ให้เราเดินเข้าไปในห้องก็จะจบเควส Synth Retention